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Segun lo que dice esta pagina es porque esta intentando arrancar desde un disco sin sistema de arranque. Si ya tenias el windows instalado que parece que es el caso, puede ser o porque este corrupto el NTLDR y/o el fichero NTDETECT.COM, en cuyo caso creo que con el sistema de recuperacion de windows (metiendo el cd) podrias recuperarlo o restaurar el windows (que no formatear).
Otra cosa que comenta la pagina es que puedas tener algun error en el sistema de arranque y con los comandos fixboot y fixmbr quizas puedas arreglarlo. Esto realmente no se si te funcionará porque si has conseguido entrar al windows con el modo a prueba de fallos es que el master boot recorder está bien.
Otra opcion que te sugiero es que entres en el modo a prueba de fallos e intentes volver a una versión anterior de windows (Inicio->programas->accesorios->herramientas de sistema->restaurar sistema. Quizas asi puedas volver a un estado del windows donde no te daba ese error.